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当然，这里说的各自作战并不是完全的，不管任何意义的各自作战，克里帝国的星际舰队有着自己的指挥体系，至高智慧是撒手了，但是在两座星际要塞上还有两名高级指挥官，由他们指挥三十二艘指挥级的星际飞船，而这三十二艘指挥级的星际飞船下属还有更多的阿尔法级的星际战舰，还有更多普通的克里巡洋舰。
有一套完整的密密麻麻的指挥体系存在，所以现在至高智慧即便是撒手，即便是和共生体之神纳尔死死纠缠在一起，但是克里帝国的整个指挥体系并没有因此而崩溃，那些普通的巡洋舰不仅听从上面的指挥，在关键时刻还要按照预案进行行动，尤其是他们被共生体战士渗透，并且有着被其占领迹象的时候。
在这种情况下，每一艘克里帝国星际飞船的指挥官都会毫不犹豫的选择将飞船开离出集团大军的范围之内，然后独自向前突进，不顾一切的发动飞船动力朝着银河回廊的方向死死的飞行，如果他们能够最终摆脱共生体的控制倒也罢了，如果摆脱不了，那么他们就会立刻轰然自曝。
而这一声自爆也向其他人说明了他们的结局，在这种情况下，共生体能够从这些飞船上获得的东西极少，而他们即便是有所收获，也绝对收获不多，而且紧跟着他们就会面对更多的星际飞船的全力打击。
而即便是这些飞船最终摆脱了共生体的纠缠，按照预案，他们也不会重新飞回到巡洋舰大军当中，他们只会选择其他的方向奔走，因为没有人能确定在这些飞船上最终活下来的，究竟是克里帝国的战士还是共生体战士？
而一旦有飞船在飞出去之后，然后又沿着原路返回，所以哪怕是他们相互之间能够进行联络沟通，但是克里帝国的星际舰队也依旧会毫不犹豫的将返回来的飞船直接击毁。
虽然他们无法完全肯定占领飞船上的就一定是共生体，但是按照之前的预案，他们根本就不应该飞回来，而一旦他们往回飞，那就已经说明他们不顾自身很可能已经被共生体潜伏的后果，坚持要带着危险回到巡洋舰大军当中，根本不顾及其他人的安危，更别说他们之前已经违反了作战预案，违反了军法条理。
