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不过王学龙还是对湖南研究基地的机构做了调整。他认为专家们对能量场的作用判断是正确的，更何况已经有了海水淡化设备这个实际例子。所以与张罗、刘楠、卢德厚商量后根据“能量场能改变原子分子间作用力是正确”这个假设，将湖南研究基地进行了改组。
理论物理研究所下辖理论物理研究室、理论验证试验室、能量场研究材料筛选研究室共三个室，张罗为所长。其中能量场研究材料筛选研究室目前最重要的工作就是寻找合适的水晶介质。
应用研究所下辖能量场里原子内作用力变化应用研究室、能量场里化学键作用力变化应用研究室、能量场痕迹寻找研究室、能量场防护研究室。其中晁华的爸爸调到能量场痕迹寻找研究室当主任，刘楠为所长。
配套设备研究所下辖一个设计室一个制造室。只负责基地试验用的少量配套设备的研制，为湛江秘密制造装配中心提供特殊部件的图纸或部件，卢德厚为所长。
高曙光高容量蓄电池项目单独为一个研究室，由高曙光组织研制。
一个分工明确，联系广泛，运行高效的研究基地终于建立起来。
不久理论物理研究所的能量场研究材料筛选研究室就找到了一种黑水晶的替代品，虽然由这种水晶建立起来的能量场有效范围只有五十多米，六十米还不到，而且散射角度大、强度随距离的变化快，但用于海水淡化、污水处理和海水贵重金属提纯还是可以的，只不过对设备要求更严一点。这种水晶在中国新疆、云南都有出产，在世界各地也有多处有出产。
